近日，金沙威尼斯欢乐娱人城金沙威尼斯欢乐娱人城牧草课题组在植物学权威期刊《Plant Biotechnology Journal》在线发表了题为《Genome assembly provides insights into the genome evolution and flowering regulation of orchardgrass》的研究论文，首次公布了优质禾本科牧草鸭茅的高质量参考基因组，为鸭茅分子育种提供了重要的基础信息支撑，此为我国第一个公布的牧草参考基因组。

    动科院黄琳凯教授为第一作者，博士生冯光燕和严海东以及诺禾致源张钟仁为共同第一作者，张新全教授为通讯作者，诺禾致源江文凯博士为共同通讯作者，川农为第一单位及第一通讯作者单位，美国农业部牧草与草地资源研究实验室Shaun Bushman研究员、弗吉尼亚理工大学Aure博士和佛罗里达大学Jiangping Wang 副教授为合作作者参与了了本项研究工作。《Plant Biotechnology Journal》为中科院生物科学和植物科学领域1区杂志，2019年影响因子为6.8，在农艺与作物学科中排名第一。

    鸭茅是一种优质多年生禾本科牧草，在欧洲，北美，大洋洲以及我国西南区等广泛种植使用，是世界四大广泛分布的禾本科牧草之一。但由于鸭茅基因组具有高重复性和高杂合度的特性，多年来一直无法获取鸭茅的参考基因组。本研究选取二倍体鸭茅为研究对象，采用二代+三代的测序策略，同时结合Hi-C染色体构象捕获技术， BioNano光学图谱以及10X Genomics技术，首次完成鸭茅全基因组测序和组装工作。本研究获取的鸭茅基因组大小约为1.84 Gb，contig N50为 0.93 Mb, scaffold N50为6.08 Mb，共鉴定到40,088个蛋白编码基因，在草类植物基因组研究领域处于领先水平。序列分析表明69%的鸭茅基因组拼接基因组序列为转座子，其中long terminal repeats (LTRs)占比最多，推测LTRs很可能在鸭茅基因组中出现扩张，以适应一百万年前更新世剧烈的环境变化。本研究还结合BSA，转录测序和QTL定位技术，挖掘鉴定到4个控制开花性状的潜在调控基因，为鸭茅农艺性状定向选择提供新的线索。

全文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.13205